（1）胎生哺乳，用种子繁殖，
（2）界，花、果实和种子
（3）腔肠动物，从单细胞到多细胞，从简单到复杂，从低等到高等，从水生到陆生

试题分析：（1）动物类群1是哺乳动物，其繁殖方式最主要的特征是胎生哺乳．植物类群3是裸子植物，能产生种子，用种子繁殖后代，适应环境的能力强，适于生活在干旱的陆地上，植物类群4是蕨类植物，不结种子，用孢子繁殖后代，属于孢子植物，孢子的生命力较低，适应能力较差，因此比种子植物低等。
（2）在分类上，该进化树的两大主干代表的分类等级是植物界和动物界．因此在分类上，该进化树的两大主干代表的分类等级是界，2是最高级的植物类群，被子植物，被子植物和裸子植物都结种子，但这两类植物又有重要区别，其中最主要的区别是被子植物的种子有果皮包被着，种子包上果皮构成果实，如苹果、大豆等都属于被子植物，裸子植物则不同，它没有果实，它的种子裸露，仅仅被一鳞片覆盖起来，如松类、杉类、柏类等。
（3）从生物进化树上，可以看出与单细胞动物亲缘关系最近的生物类群是腔肠动物，最原始的植物是单细胞藻类，从图中可以看出生物进化的总体趋势是从简单到复杂，从低等到高等，从水生到陆生。