（1） 基因    （2）变态 （3）不能

试题分析：（1）袁隆平用野生水稻与普通水稻杂交，培育出了高产的杂交水稻，表明生物基因的多样性是培育农作物新品种的基因库。
（2）青蛙的发育过程为：受精卵→蝌蚪→幼蛙→成蛙，青蛙的幼体和成体在系统结构和生活习性上差异很大，青蛙幼体生活在水中，用鳃呼吸，成体既能生活在水中，也能生活在潮湿的陆地上，用肺呼吸，像这样的发育属于变态发育。
（3）变异是指亲代间和子代个体间的差异，根据变异是否可以遗传，分为可遗传变异和不可遗传变异，遗传物质改变引起的变异属于可遗传的变异，仅由环境因素引起的变异属于不可遗传的变异，大花生种植在贫瘠的土壤中，结出的是小花生，这种变异是由环境引起的，属于不可遗传变异。